Le mur sud présente des fresques décrivant les cycles de Moïse. À l'origine, il y avait huit panneaux, à commencer par la Nativité et la Découverte de Moïse du Pérugin, remplacées plus tard par le Jugement dernier. Les fresques actuelles comprennent des scènes telles que Moïse en Égypte, la traversée de la mer Rouge et la remise des tables de la loi. Ci-dessus, la vision de Michel-Ange représente les ancêtres du Christ.